Umar al-Bashir dilahirkan di kampung kecil Hosh Bannaga, Sudan pada 1944. Beliau mula bersekolah di Hosh Bannag, beliau kemudiannya belajar di Khartoum apbila keluarganya pindah ke sana. Beliau turut melanjutkan pengajiannya di Akademi Tentera Mesir di Kaherah dan Akademi Tentera Sudan di Khartoum; beliau sebelum ini menyertai Angkatan Bersenjata Rakyat Sudan pada tahun 1960.[1] Umar turut terbabit dalam Perang Yom Kippur in 1973 dalam pasukan Tentera Mesir menentang Israel.[2]

Apabila kembali ke Sudan, al-Bashir berkhidmat dengan Tentera Pembebasan Rakyat Sudan di selatan Sudan. Setelah menjadi Jeneral pada 1980-an, al-Bashir melancarkan rampasan kuasa pada 1989 dan menumbangkan pemimpin yang dipilih secara demokrasi, Perdana Menteri, Sadeq al-Mahdi. Sejak itu al-Bashir menyekat parti-parti politik, kebebasan akhbar dan menyusun semula parlimen. Kemudian dia menjadi ketua kerajaan, perdana menteri, ketua angkatan tentera dan menteri pertahanan.